Otro topónimo hay en Fuerteventura nombrado exactamente El Calafate, que es un "bajo" al sur de la isla de Lobos, en la zona del Puertito, recogido en el corpus de Manuel Alvar y en la Toponimia de Fuerteventura (2003: IV, 52).

No sabemos si tendrá algo que ver este topónimo con el anterior y con el siguiente de La Palma, y por tanto manifestamos las mismas dudas sobre el origen de estos términos. Y no sabemos si todos ellos tendrán algo que ver con el topónimo El Calafate de la Patagonia argentina, convertido hoy en la ciudad que da entrada a los miles de turistas que visitan cada día el Lago Argentino y el glaciar Perito Moreno. Pero allí, preguntando nosotros por el nombre calafate, nos dijeron que era el de una hierba espinosa de poco talle que crecía por aquellos suelos. Sobre ello la Wiquipedia de Internet informa que su nombre científico es el de Berberis microphylla, de flores amarillas característico del sur de la Patagonia, que da unas bayas de color azul oscuro, y añade que antiguamente ese fruto se utilizaba para "calafatear" los primeros barcos que llegaban a la Patagonia, debido a la falta de cáñamo. Pero esto es muy dudoso, pues de haber sido así la planta argentina sería anterior al verbo español, mientras que el CORDE de la Academia nos informa que la palabra calafate aparece en un texto de 1529 atribuido a Francisco Pizarro como el nombre de un oficio vinculado al trabajo de la madera, por tanto anterior a que los españoles hubieran llegado a las lejanísimas tierras de la Patagonia.

Todo ello, en vez de aclarar, añade más dudas sobre el origen de este término toponímico de Fuerteventura y de los otros dos de La Palma.